Каталог / БИОЛОГИЧЕСКИЕ НАУКИ / Молекулярная биология

Исследование тканеспецифичности транскрипции генов KLRB1 и PROM1

Диссертация

Автор: Плешкан, Виктор Викторович

Заглавие: Исследование тканеспецифичности транскрипции генов KLRB1 и PROM1

Справка об оригинале: Плешкан, Виктор Викторович. Исследование тканеспецифичности транскрипции генов KLRB1 и PROM1 : диссертация ... кандидата биологических наук : 03.00.03 / Плешкан Виктор Викторович; [Место защиты: Ин-т биоорган. химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН] - Москва, 2009 - Количество страниц: 98 с. ил. Москва, 2009 98 c. :

Физическое описание: 98 стр.

Выходные данные: Москва, 2009






Содержание:

Список сокращений:
ВВЕДЕНИЕ
Цели и задачи работы
ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
11 Метилирование и другие эпигенетические факторы, влияющие на экспрессию генов
111 Гистоны и метилирование ДНК
112 Петли хроматина и метилирование ДНК
113 Метилирование при импринтинге
114 Регуляторные белки CTCF и Kaiso
115 Тканеспецифичность транскрипции генов обусловленная метилированием
12 Изменения уровня метилирования при различных патологиях
121 Гипометилирование ДНК
1211 Активация онкогенов
1212 Метилирование мобильных элементов
1213 Хромосомная нестабильность
123 Метилирование ДНК и горячие точки мутаций
13 Особенности транскрипции генов с промоторов не содержащих канонических ТАТА-последовательностей
131 Основные свойства инициаторного элемента (Inr)
132 DPE элемент промотора (Downstream Promotor Element)
133 Проксимальный (PSE) и дистальный (DSE) промоторые элементы
134 МТЕ элемент (Motif Ten Element)
135 DCE элемент (Downstream Core Element)
136 Элементы, специфические для he содержащих ТАТА-последовательность промоторов
137 CpG островки
138 Частные случаи регуляции генов не содержащих ТАТА-последовательность39 1381 Регуляция транскрипции генов NKR-P1 семейства
13811 Структура промотора гена Ly49 и тканеспецифичность экспрессии
13812 Особенности гена KLRB1
1382 Регуляция транскрипции гена PROM1
ГЛАВА 2 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
21 Определение тканеспецифичности транскрипции генов KLRB1 и PROM1
211 Транскрипция в клеточных линиях
212 Транскрипция в эмбриональном легком человека
213 Транскрипция в опухолевых и нормальных тканях легкого и пищевода
214 Исследование тканеспецифичности транскрипции в 5'-областях генов PROM1 и KLRB1
2141 5'-RACE гена KLRB 1
2142 Транскрипция изоформ гена PROM1, отличающихся по содержанию экзона 4
2143 Тканеспецифичность экспрессии транскриптов, инициированных с промоторов Р1 и Р2
22 Определение статуса метилирования участков генов PROM1 и KLRB1
221 Использование деметилирующего агента 5-Аза
222 Бисульфитное секвенирование промоторов Р1 и Р2 гена PROM1
2221 Метилирование промотора Р1
2222 Метилирование промотора Р2
2423 Характер метилирования промоторов Р1 и Р2
223 Анализ метилирования промотора Р2 метил-специфическим ПЦР
224 Метилирование и транскрипция
225 Определение метилирования в протяженных участках генов KLRB1 и PROM1
ГЛАВА 3 ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
31 Материалы
311 Ферменты и реактивы
312 Оборудование
313 Расходные материалы
314 Буферные и другие растворы
315 Микробиологические среды
316 Клеточные линии
317 Праймеры, последовательность нуклеотидов
32 МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
321 Выделение РНК и геномной ДНК
3211 Выделение РНК
3212 Определение концентрации РНК
3213 Анализ выделенной РНК методом гель электрофореза
3214 Выделение геномной ДНК
3215 Высаживание
322 Обработка ДНКазой
323 Синтез первой цепи кДНК
3231 Построение первых цепей кДНК для ОТ-ПЦР
3232 Контроль на наличие примесей ДНК, "-ОТ" контроль
3233 Построение первых цепей кДНК для 5-RACE
324 ПЦР
3241 ОТ-ПЦР
3242 Геномная ПЦР
3243 Электрофорез
325 Определение первичной структуры клонированных фрагментов ДНК и ПЦР фрагментов
326 Нуклеотидные последовательности и их анализ
327 Бисульфитное секвенирование
3271 Секвенирование CG-богатых областей генов PROM1 и KLRB1
3272 Секвенирование промоторного участка гена PROM1
328 Молекулярное клонирование
3281 Лигирование
3282 Клонирование
3283 Трансформация
3284 Выращивание ночной культуры клеток
ВЫВОДЫ:



Похожие работы:
  • Гормональная регуляция транскрипции хлоропластных генов ячменя
  • Регуляция транскрипции генов класса II у инфузории Stylonychia lemnae
  • Неравномерность транскрипции генов в составе хлоропластных оперонов ячменя
  • Уровень транскрипции генов-онкомаркеров в клетках крови больных гемобластозом
  • Роль фитогормонов и света в регуляции транскрипции хлоропластных генов в ячмене
  • Регуляция транскрипции генов системы рестрикции-модификации типа II Ecl18kI
  • Функционально важные участки Rpn4 - активатора транскрипции протеасомных генов
  • РЕГУЛЯЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ ГЕНОВ ТЕПЛОВОГО ШОКА У ДРОЖЖЕЙ Saccharomyces cerevisiae
  • Характеристика нового ЦИС - элемента регуляции транскрипции генов млекопитающих вида (GCC)4
  • Анализ регуляции транскрипции генов дыхания в гамма-протеобактериях методами сравнительной геномики